27日，审计署审计长刘家义向全国人大常委会报告2011年度中央预算执行和其他财政收支的审计情况时，介绍了50个中央部门及其270个所属单位的审计结果。其中，中科院所属单位在科研项目中发近亿元福利。
这暴露出我国科研经费的管理问题——项目立项之后，科研经费的使用，缺乏过程管理，导致一些经费成为了“唐僧肉”，没有用到科研之中，而是通过各种方式被装进有关人员的腰包。一是通过“合法”的提成进行“变现”，按照目前的科研管理办法，有科研提成一说；二是用冲账，或者扩大开支范围，此次审计的结果，就是项目承担方扩大列支范围，侵占科研经费。
对此，我国科研管理部门已有察觉，2012年，科技部等部门先后出台了《关于进一步加强国家科技计划项目（课题）承担单位法人责任的若干意见》、《国家科技项目（课题）预算管理问答》，以规范科研经费管理，发挥法人单位的审核监督作用，并要求严肃调查处理科研不端行为。
但从目前的情况看，该意见并没有得到严格执行。按照以上意见，对于侵占科研经费的科研不端行为，“一经查实，将采取通报批评、停止拨款、撤销项目与取消1-3年项目申报资格的处罚措施。”
可根据审计署的报告，对于这起涉及上亿资金的侵占行为的处理，仅仅是“对扩大零余额账户资金和科研经费支出范围问题，已将资金归还原渠道，调整了会计账目。”但愿这仅仅是初步意见，如果这样的处理是最终结果，那无疑是对违规行为的纵容。
所以，当前的紧要问题是，在强调对科研经费使用的过程管理的同时，必须严肃处理，不但要追缴科研经费，而且应该根据情节严重程度，对相关责任人进行学术处罚和行政处罚。
而要根本上治理科研立项的行政化、利益化，以及当前的福利化，必须改革当前的科研管理体制，摆脱行政管理对科研立项、评价的影响，建立学术共同体，按照学术标准，对科研项目进行管理和评价。
