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楼主  发表于: 2024-06-11 10:37

 香蕉皮防治2型DN作用机制的网络药理学研究

1 论文标题:香蕉皮防治2型DN作用机制的网络药理学研究

2 作者信息:刘米艳, 杨小松, 吴红梅*:贵州中医药大学,药学院,贵州 贵阳;王祥培:贵州民族大学,民族医药学院,贵州 贵阳

3 出处和链接:刘米艳, 杨小松, 王祥培, 吴红梅. 香蕉皮防治2型DN作用机制的网络药理学研究[J]. 中医学, 2024, 13(5): 1116-1130. https://doi.org/10.12677/tcm.2024.135170

4 摘要:目的:为了系统全面地阐明羽扇豆酮原料药材香蕉皮防治2型DN的潜在分子机制。方法:通过中国知网、维普网、万方数据知识服务平台、Pubmed等文献数据检索香蕉皮的化学成分,根据文献对活性成分防治DN的报道,同时在TCMSP数据库中以口服生物利用度(OB ≥ 30%)和类药性分析(DL ≥ 0.18)参数,筛选香蕉皮的活性成分。从TCMSP、Swiss Target Prediction、PhamMapper数据库中获取活性成分的蛋白靶点,在OMIM、GeneCards数据库检索2型DN相关靶点,通过UniProt数据库将活性成分和疾病靶点转换为基因名称。取活性成分和疾病的交集靶点,利用STRING数据库建立蛋白互作网络(PPI)。在Cytoscape软件中对PPI网络进行分析,根据网络拓扑参数筛选出关键靶点,进行可视化,并建立“成分–靶点–疾病”网络。同时将关键靶点导入到Metascape数据库进行GO及KEGG富集分析,获取香蕉皮防治2型DN的生物过程及信号通路。最后,从PDB数据库获取靶点蛋白晶体结构,利用AutoDock软件对活性成分及靶点蛋白进行分子对接模拟验证,并将结果可视化。结果:通过OB、DL筛选及文献对化学成分防治2型DN的报道,获得9个活性成分分别为槲皮素、儿茶素、β-胡萝卜素、新叶黄素、羽扇豆酮、阿魏酸、芦丁、没食子酸、柚皮苷;并筛选得到共计960个活性成分靶点和1078个疾病靶点,通过取两者的交集共得到179个香蕉皮防治2型DN的潜在作用靶点,绘制得到蛋白互作网络图。在Cytoscape软件中根据网络拓扑参数进一步筛选出INS、ALB、AKT1、IL6、TNF、VEGFA、TP53、EGFR、CASP3、MAPK8、CXCL8、MAPK1等28个关键靶点。GO功能富集分析得到氧化应激、细胞对氧化应激的反应、DNA结合转录因子活性的正调控、细胞对活性氧的反应、细胞对脂多糖的反应等1178个条目,涉及生物过程1102条,细胞组成34条,分子功能45条。KEGG信号通路富集得到AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、TNF-信号通路、Toll样受体信号通路、FoxO信号通路、MAPK信号通路、HIF-1信号通路、催乳素信号通路等130条信号通路。分子对接结果显示,除化合物芦丁、柚皮苷与靶蛋白ALB结合活性较差外,网络药理学所预测的其他活性成分与关键靶点INS、ALB、AKT1均具有较好的结合活性。结论:运用网络药理学方法初步揭示了香蕉皮防治2型DN的活性成分除羽扇豆酮外,还有多种活性成分在共同发挥作用,表明香蕉皮多成分、多靶点、多途径防治2型DN的整体调节作用特点,为香蕉皮活性成分与实验研究提供科学依据。
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