Q-PCR的绝对定量问题

如题，我实验中需要对三个目的基因进行绝对定量，得出浓度是多少copies/ml，打算选择16S作为管家基因，我想了两种方案进行定量，各位大神们帮我看下是否可行：1.购买16S的标准品，对水体中16S进行绝对定量，然后以16S作为管家基因，对目的基因进行相对定量，根据二者的比值计算出目的基因的拷贝数；2.利用Fish技术设计16S的探针，直接检测水体中16S的浓度，然后以16S作为管家基因，对目的基因进行相对定量，根据二者的比值计算出目的基因的拷贝数。因为我只做过相对定量Q-PCR，绝对定量Q-PCR和Fish都没有做过，就不知道这样是否可行，求教做过的分子生物学大神们！