糖尿病人服用二甲双胍药后改变了肠道菌群的组成和功能。
我们的肠道里生存了大约100万亿细菌，这些肠道菌群不能耐受大气中的氧气，所以很难用传统的方法进行培养。在过去的几年里，基于基因技术和生物信息学的新研究成功从细菌DNA中分析其组成和功能。肠道菌群通过产生不同的物质多方面地影响我们的生理与健康。
在疾病的研究领域中，肠道菌群的组成和功能的改变（被称为生态失调）是研究热点。然而，研究人员没有考虑药物对患者肠道细菌的潜在效应。
因此，没有办法检测哪种生态失调与特殊疾病相关，哪种肠道菌群的改变和药物治疗有关。而且在相同疾病的肠道菌群研究中出现相反的结果。这或许是因为没有考虑到药物对肠道菌群组成和功能的效应。
二甲双胍使肠道菌群产生脂肪酸。
人体消化道元基因组学项目（MetaHIT）的研究人员研究了来自丹麦，瑞士和中国2型糖尿病患者及健康人（共784人）的肠道菌群。研究目的在于区分疾病相关性与服用药物相关性的肠道微生物群改变。
研究表明治疗高血糖最常用的药物二甲双胍，可改善2型糖尿病患者的肠道细菌群落，促进肠道细菌产生某类短链脂肪酸（如丁酸，丙酸）的能力。这些脂肪酸可通过不同途径减低血糖水平。然而，二甲双胍对胃肠道有副作用，如增加胃肠气胀。这次研究为研究人员提供了一种可能的解释，这是由于经过二甲双胍治疗的患者肠道里大肠杆菌的数量增多，这是造成肠胃气胀的一个原因。
我们不能证实其他类型的抗糖尿病药对肠道菌群是否有影响。然而当我们研究没有服用二甲双胍的2型糖尿病患者，发现他们不论是丹麦人，中国人还是瑞士人，其能产生对健康有益的短链脂肪酸的细菌都少于服用二甲双胍的患者。缺乏产生短链脂肪酸的细菌菌群是否会促生2型糖尿病，目前正在调查当中。该研究的资深作者Oluf Borbye Pedersen教授说。
http://medicalxpress.com/news/2015-12-intestinal-bacteria-affected-antidiabetic-drugs.html 
