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社区获得性肺炎(CAP)是住院和死亡的常见病因。因此，了解CAP的发病率及其最重要的致病微生物相当重要。
美国疾病控制中心(CDC)进行了一项前瞻性基于人群的为期2.5年的调查，针对所有因肺炎住院的成年患者。这项研究在伊利诺伊州的芝加哥以及田纳西州的纳什维尔的5家医学中心进行，对2488例CAP患者的血液、痰和尿液检测病原体，并收集分子生物学检查以及影像学检查的数据。
在确诊为肺炎的患者中，仅有38%能够确定致病病原体；病毒占23%，细菌11%，病毒和细菌占3%，真菌或分支杆菌占1%。最常见的病原体为鼻病毒(9%)，甲型或乙型流感病毒(6%)以及肺炎链球菌(5%)。此后，检出率较高的4种病原微生物依次为病毒、支原体、金黄色葡萄球菌、腺病毒、军团菌及其他。计算肺炎的年发病率为24.8例/10,000名成年人，其中65岁及以上人群发病率最高。
78%的患者有基础疾病，依次为慢性肺病，慢性心脏病，免疫功能抑制（如药物使用，肿瘤，移植等），糖尿病，以及慢性肾脏、肝脏、脾脏或神经系统疾病。约有24%的患者接种了季节性流感疫苗；在65岁以上成年人中，44%至少接种一次肺炎链球菌疫苗。入选患者中93%影像学提示为肺炎，21%需要收入ICU，6%接受有创机械通气治疗，2%在住院期间死亡。存活患者住院日中位数为3天（四分位区间2-6天）。
观点
这项研究很重要，因其具有权威性和时效性，提供的数据对于临床医生以及卫生组织具有重要价值。研究报告的肺炎年发病率与1991年一项相似的研究结果相近1。此项研究的局限性在于所有入组者来自于两个城市中心，农村人群会和这个结果相似么？另外，总共3634符合入选标准的成年患者中，仅有2488名（68%）入选。这可能造成研究人群的偏倚。另外，应当注意研究仅纳入住院患者。
可能最为重要的发现是仅有38%的临床及影像学确诊的CAP病例能够确定病原体，尽管研究中进行了详尽的病原学检查，可能远超过常用的临床检查。研究者认为，原因可能与患者住院前使用一个或多个疗程的抗生素相关。这是否意味着检测肺炎致病微生物无意义并且不必要？当然不是，虽然每例患者都可使用一线抗生素，但可能会有不常见的病原体需要使用特殊的抗生素（如军团菌，分支杆菌及真菌）。
另外需要注意，流感病毒是第二位最常见的病原微生物，尽管研究期间(210-2012)冬季流感流行情况不严重。仅有24%的患者曾几种季节性流感。这一结果揭示了改进疫苗的必要性，尤其是那些具有合并症的患者。可能有同样问题的是肺炎链球菌疫苗。704例≥65岁的患者中（目前推荐接种肺炎链球菌疫苗的人群），仅有308例(44%)曾经接种过肺炎链球菌疫苗。降低肺炎的发生，可通过开发针对引起多数肺炎病毒的有效疫苗。
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