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几十年来,科学家已经知道ET-743是一种从海洋无脊椎动物中提取的称为被囊红树蝰的药物,该药物可以杀死癌细胞。在欧洲和美国临床试验中该药物已经批准用于病人。科学家们怀疑红树蝰被囊动物是一种海鞘类生物,实际上并不能生产ET - 743。但该药(曲贝替丁)的确切起源仍是一个谜。
通过使用先进的测序技术分析被囊类动物中微生物基因组,密歇根大学的研究人员能够分离ET- 743基因蓝图的制造者——一种称为Endoecteinascidia frumentensis类型的细菌。
这个发现大大增加对微生物的了解以及ET - 743是如何产生的,研究人员将相关内容发表在5月27日《环境微生物学》杂志上。他们积极的见解将有助于在实验室中培养出没有宿主的细菌。
“这些共生微生物长期以来一直被认为是许多天然产物的真正来源,这些天然产物从海洋和陆地无脊椎动物中分离出来。但有关于他们的信息非常少,因为我们不能使它们中的大多数在实验室环境中培养出来。”David Sherman说。
“目前,许多药物只能从宿主动物中少量获得,从经济和环境的角度来看这是不可持续的。” Michael Schofield说,“我们希望了解这些微生物的基因组,它们的内部发生的化学反应将提供经济和可持续生产药物新的途径。”
ET- 743是目前使用较复杂的部分合成工艺制成。
“一项重大的基因组样品测序包含从混合不同的生物样品中弄清楚哪一个DNA序列匹配哪一种生物样品。我们用生物信息学方法来找出相应的部分。”Sunit Jain说。生物信息学是使用电脑进行收集、分类、存储和分析生化和生物信息的一项技术。
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