1 论文标题：系统性红斑狼疮受DNA甲基化影响的关键基因分析
2 作者信息：董斐雅, 侯甜甜, 董佳琪, 樊国梁*：内蒙古大学物理科学与技术学院，内蒙古 呼和浩特；张晓炜*, 刘 暘：内蒙古医科大学第一附属医院风湿免疫科，内蒙古 呼和浩特
3 出处和链接：董斐雅, 侯甜甜, 董佳琪, 张晓炜, 刘暘, 樊国梁. 系统性红斑狼疮受DNA甲基化影响的关键基因分析[J]. 生物物理学, 2024, 12(1): 9-21.
https://doi.org/10.12677/BIPHY.2024.1210024 摘要：系统性红斑狼疮(SLE)是一种自身免疫性疾病，表观遗传变异在SLE的发病机制中起重要作用。已有研究证明，异常DNA甲基化发生在SLE发展的各个过程中，调控相关基因表达水平。因此，寻找受影响的关键基因有助于SLE的诊断和治疗。首先，本文从Gene Expression Omnibus (GEO)数据库中下载了基因表达数据和DNA甲基化数据，利用生物信息学的方法，对在外周血单核细胞(PBMC)的基因表达和DNA甲基化数据进行差异分析，甲基化差异表达的基因被记录为差异甲基化基因(DMG)与差异表达基因(DEG)之间的重叠基因。使用DAVID数据库对受甲基化影响基因(mDEG)的功能富集分析。然后使用STRING数据库构建蛋白质–蛋白质相互作用(PPI)网络以获得参与SLE的关键基因。之后，本研究利用受试者工作特征(ROC)曲线评估hub基因，以验证其区分SLE与健康对照组的能力。最后，我们构建了一个hub基因-miRNA网络，并对共享基因进行了功能富集。
