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近期，Medscape上发表了关于如何优化肠道微生物群落的文章，总结了目前我们对生活方式如何影响微生物健康的理解。
改变微生物的决策
肠道微生物，胃肠系统的动态特性，有可能显著影响健康结果。通过与宿主免疫系统和信号通路复杂的相互作用，肠道微生物群可以显著影响疾病的发病机制，如癌症、代谢综合征、炎症性肠病和非酒精性脂肪肝病。
最近的技术改善不仅大大加深了我们对肠道微生物群的理解，也提高了对优化后可以带来健康益处的潜在机制的理解。正如一个人的饮食对肠道菌群有部分决定作用，也很可能有明显的影响肠道微生物的饮食因素，并可能与广泛的系统性疾病之间存在相互作用。此外，睡眠和运动等新兴因素的有关数据突显出影响微生物的潜在作用。
饮食注意事项
各种膳食碳水化合物，包括益生元食物成分、可发酵纤维和牛奶低聚糖，已被证明可以使肠道菌群产生显著的变化。这些微生物群落的变化往往表现为双歧杆菌和乳酸杆菌的水平升高。最近的一项研究显示，柔嫩梭菌群物种、Akkermansia和其它极少深入研究的群落成员也可变得丰富。1
与肠道微生物群饮食调整有关的临床结果调查，显示了系统的以及特定的健康益处。1已经对由单糖线性排列组成的益生元低聚糖以及含有碳水化合物的高纤维食物进行临床研究。然而，受试者的响应不一致可能使饮食干预的结果难以预测，限制不同患者具体建议的价值。
益生元
益生元可以通过选择性结肠内细菌增长和活性有利的影响宿主。他们通过选择性发酵可以改变胃肠道微生物群落组成和（或）活性。归类为益生元的食物必须能耐受胃酸、哺乳动物的酶水解，并在上消化道被吸收，以便它能够被肠道微生物群发酵成可用于能量的短链脂肪酸（包括乙酸、丙酸和丁酸）。
因此，益生元不仅会通过促进一个特定肠道微生物群落的生长引起微生物群的变化，也作为生物活性代谢产物产生的基质。主要的益生元是天然果聚糖和低聚果糖，还有许多其它的，包括低聚半乳糖。益生元碳水化合物发酵产生丁酸等短链脂肪酸以及其它降低pH值的最后产物，通过人结肠细胞粘蛋白生产，并诱导免疫调节细胞因子，这些可能有潜在的疾病调制效应。
益生元纤维通常是多种食物的天然成分，特别是全谷物、水果、块根类蔬菜和豆类。虽然一些食物都有明显的益生元含量，可能是这些食物在西方饮食中所占比例很少，不能提供足够的利于结肠的可发酵纤维。当需要补充时，益生元纤维产品，如车前草是常用的。作为项实践性决策，可发酵纤维或组合益生元的消耗可以丰富肠道微生物群落，使其更大、更多样化，对大多数疾病这应该是一个标准的推荐。
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