讨论往往是论文中最长也是最难写的部分，是作者对研究结果和发现进行分析、推断、演绎和推理的过程，要求作者具有很强的逻辑思维能力和英文组织能力。讨论从理论上对实验和观察结果进行分析和综合，从广度和深度2个方面丰富和提高对研究结果的认识，为文章的结论提供理论依据。讨论的内容应以实验、观察结果部分为基础和线索，进行适当的分析推理。根据国际医学期刊编辑委员会的建议，讨论应注意以下几点：
1)强调本研究中新的和重要的发现，以及从中引出的结论，但不要重复论文中已经有的一些详细资料和结果。
2)阐明有关新发现的意义及某些限制;至于可能涉及对今后研究的影响因素，或者其他类似的研究结果，可以讨论其间的相关联系等。
3)讨论一定要与本研究的目的紧密联系，避免对本研究作不恰当的论述，以及对资料本身尚不足以证实的观点盲目定论。
4)除非进行卫生经济学分析，否则不要对研究的成果做成本效益的结论。
5)要避免提出及暗示尚未完成的研究之重点事项。在有依据的情况下，可以提出今后探讨的新的假设。如果研究结果十分理想，可提议推荐应用。
讨论部分要避免冗长的、文献综述式的阐述，最好分段撰写论文讨论部分，做到层次分明，叙述清楚，能够做到引经据典，有分析、有综合、有比较、有新意。讨论还可对结果中不够完善、有漏洞处进行补充说明。因此，应充分掌握有关文献资料，特别是对文章结论相符或相悖的文献，否则会对研究结果做出不恰当的评价。讨论可分以下几个部分撰写：
1)简要介绍研究背景，并陈述研究获得的主要阳性和阴性结果。
2)探讨与国内外其他研究比较的长处和短处，特别要讨论产生差别的原因及意义。
3)通过对结果的分析以及与其他研究的比较，阐明本研究的主要意义，包括本研究已解答的问题，还有哪些问题尚待进一步解决，从而为临床医师或决策者建议使用前景。
4)指出研究存在的不足和今后研究的方向。
讨论应围绕主题与目的，从实验结果出发，简明扼要，有的放矢，切忌重复。对前人的工作要集中概括，引证要选近代的、主要的资料。凡是实验结果中提不出讨论线索和依据的，不应纳入讨论中。
此外，讨论中引用的文献，除特殊情况下(经原作者允许)，一般不允许成段、成句(连续引用不能超过300字)地列于文中，而是摘其观点和结论，改用自己的语言表述，并在文中注明文献出处。
