选题是论文写作的第一步，也是论文质量的关键，选题一定要慎重。在中医论文写作的过程中，选题不当会造成不可挽回的先天性缺陷，无论再做何种努力，都难以提高论文质量，要么勉强成文，要么中途仓促换题，其结果均不理想。故要特别重视选题问题。中医论文首先要具有学术价值，这是评价论文质量的公认指标。学术性的标准可以概括为"新、深、实"三方面。"新"是论点或方法上具有创新性，对某一课题有新意，有独到的见解；"深"是研究课题有一定的深度，能抓住事物本质，对推动学科建设和发展有积极意义；"实"是所用的资料具有权威性，时间合理，论据经过组织和加工能获得结论。中医学位论文一般只选择成功的经验。
选题原则同学选题时常有无所适从的感觉，可以向已获得学位的人请教，学习他们做学位论文的经验体会。要多看资料，各家观点比较之后，自然会找到感觉，产生新的认知，或求得老师、同事的点拨，从中获得悟性。提倡在学科边缘或学科交叉点上选题，容易取得突破性进展。学位论文的选题强调先进性、实用性、可行性。
1、创新性:又称先进性，新颖性。创新性是中医论文的生命力，具有创新性才有传播价值，是衡量论文质量的首要条件。一般而言，学士论文要求对研究课题有体会，文题优于同类选题。硕士论文要有创造性见解。创新性表现在作者论述的主题是本学科前人未曾研究，或对已有的研究结果仍值得深入探讨。论文有新的创意，如采用新的技术方法，阐述了新理论、新内容，提出了新的观点等。用通俗的话讲：就是说了前人没有说过的话，属创见性论文；说了前人没说完的话，属发展性论文；说了与别人不同的话，属争鸣性论文。
2、实用性：又称应用性，是对科技论文的基本要求，也是衡量中医论文质量的重要指标，是论文在理论上、方法上或技术上的实际应用价值。实用性是从中医学科发展和社会需要的实际出发，选题紧紧围绕中医临床实践的特色和优势，以及保障人民健康的迫切需要，着重选择一些具有临床实用价值或理论意义的课题。1）选题是否从学科研究和临床实践中产生，是否反映了科学研究的新成果、新问题。2）论点、论据资料是否从科研或临床中取得的第一手材料，不可东拼西凑、道听途说。
3、可行性：一切从实际出发，在选题过程中应当正确估量自己的主客观条件，选择力所能及的课题，不脱离实际、不可好高莺远，贪大求洋。题目宜小不宜大，学位论文的撰写有时间限制，一般从选题到总结只有半年的时间。要小题大作，针对某个具体问题集中论述，层层剥茧，步步深入，题目虽小而内容丰富，容易取得新见解。选题太大，在规定时间内完成不了论文，或内容空泛，难以深入而招致失败。题目太小也不行。
学位论文要紧密围绕研究项目、人员构成、必需物质基础等构成课题的三要素，量力而行。课题份量和难易程度要恰当，要使研究工作达到一定的工作量，并在规定的时间内做出结果。要充分考虑现有临床条件、实验条件等，以及作者具备的各种条件，能否满足研究工作和论文写作的实际需要。
