Cell：单分子测序揭示惊人的基因组重排8 G- d9 Y, c2 [7 F; S% ?
2014-09-10 1 来源：生物360 作者：koo
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科学家们发现，生活在池塘里的单细胞生物Oxytricha trifallax有一种非凡的能力，它们能在交配时将DNA打碎并快速重排这些片段。这项研究发表在上一期的Cell杂志上。
Oxytricha的基因重排是一个非常精密的过程，“这是大自然早期一种的复杂化尝试，”文章的资深作者，Princeton 大学教授Laura Landweber说。9 |: s S9 t6 O& o6 U
从实用性的角度看，人们可以将Oxytricha当成模式生物，研究高等动物的染色体重排。在癌症早期，染色体会经历混乱的重排事件，而Oxytricha可以一步步地展现这一过程。
这项研究中的Oxytricha基因组是通过PacBio单分子测序完成的，Pacific Biosciences公司开发的这一技术可以实现超长的测序读取。
Landweber介绍道，Oxytricha与其它微生物截然不同，Oxytricha细胞大约是人类细胞的十倍大，而且拥有两个细胞核。体细胞核含有5%的遗传信息，有转录活性，负责调节细胞的内部活动。而生殖系细胞核保存着要传递给下一代的全部遗传信息，没有转录活性。研究显示， Oxytricha在发育过程中，能通过大规模的程序化DNA重排，将生殖系细胞核转变为体细胞核。! ]; u7 |3 l0 W# U7 ?6 U# ~* j
事实上，Oxytricha交配只是为了交换DNA。在营养充足的时候，Oxytricha主要采取无性繁殖，不断地有新细胞出芽。在营养匮乏的时候，两个Oxytricha发生融合并分享遗传信息（交配），拆散并重排生殖系细胞核的基因和DNA，共同构建拥有一套新染色体的体细胞核。这一过程能让Oxytricha焕发青春活力，也提高了遗传物质的多样性， Landweber说。" s3 r5 O: t3 l0 t
在Oxytricha的交配过程中，生殖系细胞核选出大约225,000个小DN段，来构建新染色体。Landweber实验室之前的工作表明，上一代Oxytricha的数百万非编*****RNA引导着上述过程，它们以正确的顺序标记和分选DN段。4 B$ C0 A# J6 O8 [! T& e
此外，Oxytricha庞大的基因组也令人印象深刻，Landweber说。2013年她的团队发现，这种生物的体细胞核含有大约16,000染色体，这些染色体大多只含有一个基因。8 o0 @/ K( X2 A B6 t) o
Oxytricha的独特遗传学机制为DNA提供了很好的保护，有利于将强健的遗传物质传递下去。正因如此，这种生物才能够广泛分布在世界各地。
原文检索：1 N$ s( K% f( t& a4 q0 Z2 P
Xiao Chen, John R. Bracht, Aaron David Goldman, Egor Dolzhenko, Derek M. Clay, Estienne C. Swart, David H. Perlman,Thomas G. Doak, Andrew Stuart12, Chris T. Amemiya, Robert P. Sebra, Laura F. Landweber. The Architecture of a Scrambled Genome Reveals Massive Levels of Genomic Rearrangement during Development. Cell, 28 August 2014; DOI: 10.1016/j.cell.2014.07.034
