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日前,华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室教授严建兵团队率先实现了玉米单细胞测序。相关成果发布在《自然通讯》上。
四分体是一次细胞减数分裂后的直接产物,是遗传重组分析的理想材料。分离四分体的四个小孢子并进行单细胞基因型分析是研究遗传重组机制的最佳方案,尽管目前动物单细胞测序技术较为成熟,但在植物中,由于细胞壁的存在,让单细胞DNA难以获取,致使这一研究举步维艰。 面对这一挑战,严建兵团队通过对玉米24个四分体96个小孢子的全基因组低通量测序分析,获得了近60万高质量的SNP标记,构建了接近单碱基水平的重组图谱,首次准确计算出玉米一个细胞一次减数分裂平均发生重组交换的次数,定位了多个重组热点区域。该研究首次证实了在植物中存在较强的重组负干涉和复杂的染色单体干涉、环境因素显著影响重组频率等重要遗传学现象。
专家指出,该技术不但可以应用于其他植物的单细胞测序研究,同时也是玉米重组规律的新认识,并丰富了遗传学理论,为作物的遗传育种提供了有价值的信息。(来源:中国科学报 彭科峰)